Trực khuẩn gram âm Klebsiella, Enterobacter và Serratia có liên quan mật thiết với hệ vi khuẩn đường ruột bình thường mà hiếm khi gây bệnh ở những người bình thường.
Nhóm HACEK (loài Haemophilus, Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Cardiobacterium hominis, Eikenella corrodens, Kingella kingae) bao gồm các sinh vật gram âm có độc lực yếu, chủ yếu gây viêm nội tâm mạc. Điều trị bằng thuốc kháng sinh.
Loài trực khuẩn gram âm Haemophilus gây nhiều nhiễm trùng nhẹ và nghiêm trọng, bao gồm vãng khuẩn huyết, viêm màng não, viêm phổi, viêm xoang, viêm tai giữa, viêm mô tế bào và viêm thanh quản.
Trực khuẩn gram âm Escherichia coli O157: H7 và các vi khuẩn E.coli đường ruột khác (EHEC) thường gây tiêu chảy cấp có máu, có thể dẫn đến hội chứng tán huyết-urê huyết. Triệu chứng là đau bụng và tiêu chảy có máu. Sốt không nổi bật.
Trực khuẩn gram âm Escherichia coli là sinh vật sống chung hiếu khí nhiều nhất trong ruột già. Một số chủng gây tiêu chảy và tất cả có thể gây nhiễm trùng khi xâm nhập vào các vùng vô trùng (ví dụ như đường tiểu).
Vi khuẩn không tả bao gồm trực khuẩn gram âm Vibrio parahaemolyticus, V. mimicus, V. alginolyticus, V. hollisae, và V. vulnificus; chúng có thể gây tiêu chảy, nhiễm trùng vết thương hoặc nhiễm trùng huyết.
Bệnh tả là một bệnh nhiễm trùng cấp tính ở ruột non do trực khuẩn gram âm Vibrio cholerae tiết ra độc tố gây tiêu chảy nhiều nước, dẫn đến mất nước, thiểu niệu và trụy tuần hoàn. Sự lây nhiễm thường qua nước bị ô nhiễm hoặc động vật có vỏ.
Bệnh Brucellosis là do các loài trực khuẩn gram âm Brucella gây nên. Các triệu chứng bắt đầu như là một bệnh sốt cấp tính có ít hoặc không có dấu hiệu khu trú và có thể tiến triển đến giai đoạn mạn tính với sốt tái diễn, yếu cơ, đổ mồ hôi, nhức mỏi cơ và đau cơ.